В отношении обвиняемого возбудили уголовное дело по статьям «Организация деятельности экстремистской организации», «Участие в деятельности организации, которая в соответствии с законодательством Российской Федерации признана террористической».
По версии следствия, Фанис Гайнутдинов с 2003 года является участником международной террористической организации «Хизб ут-Тахрир аль-Ислами». Деятельность этой организации запрещена на территории РФ. По решению суда ему назначили наказание в виде 5 лет лишения свободы.
Однако, когда Гайнутдинов вышел из тюрьмы, он продолжил принимать участие в запрещенной террористической организации. Он осуществлял вербовку новых участников при личных встречах и через интернет. После возбуждения уголовного дела у Гайнутдинова был проведен обыск, в ходе которого нашли книги и брошюры экстремистского характера.
Судья назначил ему наказание в виде 6 лет лишения свободы с отбыванием в исправительной колонии общего режима.