Пермская полиция начала расследование 19 мая 2014 года. С 15 января 2015 года Потанин, который работал и жил уже в Москве, начал уклоняться от явки к следователю. И с 6 февраля был объявлен в федеральный розыск. 28 февраля 2015 года бизнесмена задержали. По версии следствия, в 2011-2012 годы Потанин злоупотребил полномочиями, без одобрения совета директоров выдав займы из ЗАО «ЭТК» собственному ООО «ЭТК «Кама» и сорвав поставки оборудования для ОАО «Роснефть». Это привело к убыткам еще на 566 млн рублей и к ликвидации производственной базы ЗАО «ЭТК». Бизнесмен обвинен также в 8 растратах, связанных в том числе с выдачей займов своей жене, и 5 эпизодах легализации (отмывании) преступно приобретенного имущества.
СЧ СУ управления МВД РФ по Перми завершила 3 мая 2016 года ознакомление обвиняемого и защиты с собранными уликами. А через 10 дней Пермский краевой суд продлил в виде исключения арест на срок до 16 месяцев 21 суток - то есть до 19 июля. Потанин пожаловался в апелляционную инстанцию этого же суда. Выступая по видеоконференсцсвязи из СИЗО № 1, бизнесмен 20 мая попросил изменить меру пресечения на домашний арест.
«ЗАО «ЭТК «Кама» относилось к крупнейшим налогоплательщиком Пермского края. В 2011-2012 году было выплачено налогов на 640 миллионов рублей. Мое ООО «ЭТК «Кама» имеет годовой оборот в 11 миллиардов рублей и выплачивает сотрудникам, дистанционно работающим по всей России, полмиллиарда рублей зарплаты. Я сижу уже 15 месяцев, хватит! С электронным браслетом на ноге я от домашнего ареста никуда не убегу. Скрываться не намерен. Я честный человек, многодетный отец. Это дело - заказное, «кривое», - заявил Потанин и назвал адреса трех квартир в Перми, где мог бы находиться под домашним арестом.
Среди квартир была упомянута и та, которую осенью 2012 года он подарил несовершеннолетней тогда дочке - площадью 232,2 кв. метра. Кроме того, бизнесмен успел подарить дочери 9-комнатную квартиру в Усть-Качке площадью 482,4 кв. метра, а также 54/700 доли нежилых помещения в Перми площадью 997,1 кв. метра.
Прокурор Ирина Климова напомнила о федеральном розыске обвиняемого и назвала продление содержания под стражей до 19 июля обоснованным. Апелляционная инстанция поддержала такую позицию.